در تصفیه به روش بیولوژیک از آنجا که مواد آلی پیش بینی شد با شاخص آلودگی بالا (BOD و COD) به سیستم هوادهی می شود از تلفیق روش های تصفیه بیولوژیک هوازی و بی هوازی استفاده شد در ابتدا فاضلاب وارد حوضچه های بی هوازی می شود در این مرحله علاوه بر کاهش چشم گیر BOD و BOD مشخصات شیمیایی فاضلاب متعادل می شود بعد از این مرحله فاضلاب وارد مرحله هوازی می شود. روش هوادهی گسترده (EAAS) در روش های هوازی با توجه به شرایط محیطی و جغرافیایی محل انجام پروژه مورد استفاده قرار گرفته شد.
در روش های هوازی، هوازی دائماً به راکتور هوازی از طریق بلوئرهای هوادهی تزریق می گردد. مرحله بعد واحد ته نشینی می باشد که لجن حاصل از فرآیند هوازی در این مرحله ته نشین می شود. بعد از ته نشینی فاضلاب تصفیه شده به حوضچه تماس کلر هدایت می شود در آنجا گندزدایی شده و بدون رنگ، بو و شاخص های آلی آلوده کننده برای شستشوی سالن ها، محوطه و … و هم چنین مصارف کشاورزی هدایت می گردد. در مرغداری با توجه به حساسیت های بالا از نظر آلودگی های میکروبی، ویروسی و باکتریولوژی روش تصفیه فاضلاب و خروجی مطلوب آن بسیار حیاتی می باشد، چرا که اگر حذف مواد آلی و بیماری زا به خوبی صورت نگیرد می تواند ضررهای جبران ناپذیری را به واحد پرورش وارد می کند.
